Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sv2cQ69ZS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sv2cQ69ZS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sv2cQ69ZS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sv2cQ69ZS6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms