Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf280dQ68FE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf280dQ68FE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf280dQ68FE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms