Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf4Q64287 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf4Q64287 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf4Q64287 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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