Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col4a5Q63ZW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Col4a5Q63ZW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col4a5Q63ZW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col4a5Q63ZW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms