Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zic2Q62520 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zic2Q62520 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zic2Q62520 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms