Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcncQ62447 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcncQ62447 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcncQ62447 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcncQ62447 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcncQ62447 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcncQ62447 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcncQ62447 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms