Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssr4Q62186 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssr4Q62186 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssr4Q62186 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms