Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx3xQ62167 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx3xQ62167 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx3xQ62167 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms