Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim27Q62158 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim27Q62158 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim27Q62158 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms