Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a2Q62148 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh1a2Q62148 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh1a2Q62148 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh1a2Q62148 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms