Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctr9Q62018 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctr9Q62018 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctr9Q62018 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms