Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin1Q61644 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pacsin1Q61644 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pacsin1Q61644 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin1Q61644 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms