Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EsrrbQ61539 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EsrrbQ61539 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EsrrbQ61539 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EsrrbQ61539 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms