Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AlcamQ61490 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AlcamQ61490 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AlcamQ61490 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms