Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd55bQ61476 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd55bQ61476 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd55bQ61476 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms