Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi1Q61474 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msi1Q61474 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi1Q61474 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms