Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccne1Q61457 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccne1Q61457 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccne1Q61457 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccne1Q61457 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms