Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccna1Q61456 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccna1Q61456 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccna1Q61456 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccna1Q61456 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccna1Q61456 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccna1Q61456 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccna1Q61456 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms