Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc9a1Q61165 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a1Q61165 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc9a1Q61165 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc9a1Q61165 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms