Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc6Q61143 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc6Q61143 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpc6Q61143 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms