Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vdac1Q60932 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vdac1Q60932 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vdac1Q60932 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vdac1Q60932 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vdac1Q60932 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vdac1Q60932 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms