Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2cQ60772 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn2cQ60772 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdkn2cQ60772 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdkn2cQ60772 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms