Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn11Q60771 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn11Q60771 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn11Q60771 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms