Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcf4Q60722 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf4Q60722 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcf4Q60722 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf4Q60722 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf4Q60722 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms