Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P4ha2Q60716 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P4ha2Q60716 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
P4ha2Q60716 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P4ha2Q60716 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms