Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxd4Q60688 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd4Q60688 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms