Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uimc1Q5U5Q9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uimc1Q5U5Q9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uimc1Q5U5Q9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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