Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
Scaf1Q5U4C3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Scaf1Q5U4C3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Scaf1Q5U4C3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Scaf1Q5U4C3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Scaf1Q5U4C3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms