Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med13Q5SWW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Med13Q5SWW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med13Q5SWW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med13Q5SWW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms