Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynrgQ5SV85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynrgQ5SV85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynrgQ5SV85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynrgQ5SV85 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms