Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ankrd40Q5SUE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd40Q5SUE8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd40Q5SUE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd40Q5SUE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms