Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znrf3Q5SSZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znrf3Q5SSZ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znrf3Q5SSZ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znrf3Q5SSZ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znrf3Q5SSZ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znrf3Q5SSZ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znrf3Q5SSZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znrf3Q5SSZ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms