Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam46cQ5SSF7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam46cQ5SSF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam46cQ5SSF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam46cQ5SSF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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