Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CoblQ5NBX1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CoblQ5NBX1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CoblQ5NBX1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms