Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnni3kQ5GIG6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnni3kQ5GIG6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnni3kQ5GIG6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnni3kQ5GIG6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 297.2 ms