Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ecm2Q5FW85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ecm2Q5FW85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ecm2Q5FW85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ecm2Q5FW85 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms