Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrc3Q5DU56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Nlrc3Q5DU56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrc3Q5DU56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Nlrc3Q5DU56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrc3Q5DU56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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