Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syce1lQ5D525 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1lQ5D525 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syce1lQ5D525 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syce1lQ5D525 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syce1lQ5D525 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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