Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire1Q52KF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spire1Q52KF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spire1Q52KF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire1Q52KF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spire1Q52KF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire1Q52KF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spire1Q52KF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms