Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfhr2Q4LDF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfhr2Q4LDF6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfhr2Q4LDF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfhr2Q4LDF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms