Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tigd5Q499M4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tigd5Q499M4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tigd5Q499M4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tigd5Q499M4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms