Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1nQ497L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al1nQ497L1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al1nQ497L1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms