Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3E1

Ubash3a, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3aQ3V3E1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ubash3aQ3V3E1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubash3aQ3V3E1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubash3aQ3V3E1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubash3aQ3V3E1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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