Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms