Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnah12Q3V0Q1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnah12Q3V0Q1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnah12Q3V0Q1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnah12Q3V0Q1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnah12Q3V0Q1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnah12Q3V0Q1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Dnah12Q3V0Q1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnah12Q3V0Q1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms