Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fchsd2Q3USJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fchsd2Q3USJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fchsd2Q3USJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fchsd2Q3USJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fchsd2Q3USJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms