Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp560Q3URI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp560Q3URI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp560Q3URI6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp560Q3URI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms