Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rmi2Q3UPE3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rmi2Q3UPE3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rmi2Q3UPE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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