Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrc4Q3UP24 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrc4Q3UP24 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrc4Q3UP24 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms