Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uspl1Q3ULM6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uspl1Q3ULM6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uspl1Q3ULM6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uspl1Q3ULM6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Uspl1Q3ULM6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms